اين مسجد مقابل  شهرداري خامنه و در كوچه مير پنج قرار گرفته است مسجد حسین خان میرپنج در تاريخ 1284 هجري قمري توسط حسين خان مير پنجه سردار توپخانه مظفرالدين شاه قاجار بنا نهاده شده است و در سال 1386 به ثبت آثار ملي ايران رسيده است.این مسجد تنها مسجد منقش شهزستان شبستر می باشد . این مسجد دارای سه درب وردی می باشد  درب شمالی که به مقبره حسین خان گشوده می شود  درب شرقی که قبلا به عمارت حسین خان باز می شده بود که اینک تخریب شده و آثاری از آن عمارت باشکوه باقی نمانده و این درب هم اینک به باغ حسین خان باز می شود و درب جنوبی که مستقیما به باغ مسجد نظاره می کند  هنگام ورود از درب اصلی مسجد که درب شرقی آن می باشد وارد باغ مسجد باغی در حدود 2000 متر مربع می شویم که درختان میوه این باغ طراوت خاصی به باغ بخشیده است در وسط باغ حوض بزرگی به ارتفاع 2 متر  خود نمایی می کند از مقابل حوض تا مسحد باغچه بزرگی قرار داشته که امروزه یک درخت زال زالک در میان حیاط فرش شده سنگی یادآور آن باغچه باطراوت است در قسمت شمالی باغ ایوان مسجد دیده می شود که با نقاشی های مربوط به واقعه عاشورا تزئین یافته  ستون های نقاشی شده با خطوط اسلیمی فضای معنوی بنا را دو چندان می کند در دو  سمت راست و چپ سه در  قرار دارند در سمت راست درب نخست از طریق راه پله به زن نشین می رسد زن نشین مسجد طوری ساخته شده است که صحن اصلی مسجد از آن جا دیده می شود  درب دوم مسجد به آبدار خانه مسجد  گشوده می شود که درست در زیر قسمت زن نشین قرار دارد  و درب سوم به صحن اصلی مسجد باز می شود  البته در ب اصلی صحن اصلی از سمت چپ مسجد می باشد بعد از عبور از ایوان به طول به سمت چپ مسجد می رسیم درب اول ما را به صحن اصلی مسجد راهنمایی می کند  هنگام ورود با مسجد مواجه می شویم که دارای سقف چوبی به مساحت است که توسط ستون نگه داشته شده است در سمت جنوبی مسجد محراب آن با گچ بری خاص دوران قاجار تزئین یافته است همچنین قسمت هایی از دیوارهای مسجد بوسیله دوده خطاطی شده است که نام اهل بیت (ع) مضمون این خطوط زیبا را تشکیل می دهد در روبه روی محراب مسجد که منبری چوبی متعلق به دوران قاجار در آن قرار دارد بر روی تیرهای چوبی مسجد تاریخ تاسیس مسجد توسط سرهنگ توپخانه قاجار  حسین خان 1284 قمری ذکر شده است هنگام خروج از درب اصلی مسجد به درب دیگر مسجد می رسیم که  درب دوم سمت چپ به آشپز خانه مسجد منتهی می شود که با پنجره هایی همانند قسمت آبدارخانه به طول به صحن اصلی مسجد باره می کند و درب انتهایی ما را به مسجد می رساند  درب سوم سمت چپ به زن نشین دیگر مسجد ما را راهمایی می کند که بعد از عبور از پله به زن نشین  دیگر مسجد می رسیم البته این دو زن نشین در گذشته از داخل به یکدیگر متصل می شدند که در سالهای گذشته تخریب گشته و ارتباط دو زن نشین با یکدیگر قطع شده است این زن نشین که با استفاده از سه پله چوبی که در دیوار شمالی طراحی شده پشت بام مسجد راه دارد این بنای خشتی – چوبی با همکاری سازمان میراث فرهنگی استان در حال بازسازی می باشد.